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    藥物所與阿爾脈聯合團隊摘取分子翻譯國際挑戰賽冠軍

    發布于 2021-06-10 由 zhaojunli 發布

    經過3個月的激烈角逐,由著名數據科學競賽平臺Kaggle舉辦的百時美施貴寶-分子翻譯大賽已于北京時間6月4日上午8點結束。此次比賽吸引了來自世界各地的近千名數據科學家參加。由阿爾脈生物科技劉小紅博士與中國科學院上海藥物所藥物發現與設計中心博士生鐘飛盛、熊嘉誠組成的“SIMM DDDC”聯合團隊,在鄭明月研究員指導下,從874只隊伍中脫穎而出,獲得了此次大賽的第一名(見圖1)。

    圖1 分子翻譯大賽排名

    本次比賽的目標是從圖片中識別化學結構并將其轉換為國際化合物標識 (International Chemical Identifier, InChI)。在期刊和專利等出版物中,有機分子通常是由化學結構式來描述,自動地從此類文件中識別化學結構可以讓化學家快速地獲取信息用以決策。此外,分子圖像翻譯得到的InChI文字化學式可以視作包含豐富語義的文本數據,可以與同樣是文本形式描述的生物、藥理等其他數據和信息更方便的進行整合,從而形成系統的數據庫。

    數據是算法的基石,如何有效地獲取高質量的數據集用于建模是藥物研發領域亟待解決的問題?!癝IMM DDDC”隊伍開發的算法能從圖片中準確地提取化合物的結構信息,該方法可以用于真實世界的化學文獻和專利數據的自動挖掘和分析,這將極大地促進生物醫藥大數據的構建,進而為后續人工智能算法的開發奠定堅實的基礎。

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